Костанайский государственный университет имени А.Байтурсынова осуществляет двухуровневую систему подготовки кадров на основании лицензии на право ведения образовательной деятельности по специальностям высшего и послевузовского образования.

Содержание образовательных программ предусматривает теоретическое обучение (изучение цикла общеобразовательных дисциплин, цикла базовых дисциплин, цикла профилирующих дисциплин), прохождение профессиональных практик, а по специальностям послевузовского образования выполнение научно-исследовательской работы. Каждый цикл дисциплин состоит из дисциплин обязательного компонента и компонента по выбору. Дисциплины компонента по выбору позволяют в рамках выбранной специальности формировать образовательные программы, ориентированные на целенаправленную подготовку кадров для конкретной сферы профессиональной деятельности человека.

Все дисциплины компонента по выбору разбиты на 2 группы: дисциплины, формирующие образовательную программу, и дисциплины свободного выбора студентами, так называемые общие элективные дисциплины. Дисциплины образовательной программы прописываются комплексно сразу на весь период обучения и составляют 70-80 % от общего объема кредитов компонента по выбору. Общие элективные дисциплины могут изменяться, либо в их список могут добавляться новые дисциплины. Они необходимы для того, чтобы исключить формирование излишне узконаправленного специалиста.