Наука в КГУ им. А.Байтурсынова сегодня – это научные школы, профессорско-преподавательский состав высшей квалификации, научное издание, эффективно работающая магистратура и докторантура, сотрудничество с зарубежными вузами. Эти совместные усилия – достойный вклад в развитие отечественной науки во благо региона.

Университет нацелен на интеграцию образовательной и научной деятельности, развитие приоритетных научных направлений и поддержку творческой молодежи. В университете созданы все необходимые условия – обеспечен доступ к информационным источникам, оказывается организационно-правовая поддержка, выделяются материально-технические ресурсы. Наука начинается с тех, кто ее создает, хранит и передает знания в будущее. К выполнению научно-исследовательской работы привлечены практически все преподаватели, магистранты и докторанты, а также часть студентов.

В настоящее время в университете сложились научные школы по направлениям прикладных наук:

● повышение генетического потенциала продуктивности сельскохозяйственных растений и совершенствование агротехнологий для различных агроэкологических зон Северного Казахстана на основе инновационных принципов интенсификации, экологизации и ресурсосбережения, обеспечивающих устойчивую продуктивность сельскохозяйственных угодий и воспроизводство плодородия почв;

● повышение генетического потенциала продуктивности, совершенствование технологий кормления, содержания и воспроизводства сельскохозяйственных животных, птиц и рыб в Северном Казахстана;

● разработка методов, в т.ч. биотехнологических, диагностики средств профилактики и лечения болезней с/х животных, птиц и рыб, обеспечение продовольственной безопасности;

● разработка и внедрение инновационных технологии в области механизации, автоматизации и технического сервиса в отраслях агропромышленного комплекса;

● разработка энергосберегающих, энергоэффективных технологий и альтернативных источников энергии. Разработка перспективных конструкционных материалов для современной техники;

● повышение качества, актуальности и эффективности профессионального образования. Разработка и внедрение новых информационных технологий в образовательный процесс;

● научное обоснование системы экономических отношений в агропродовольственной сфере, обеспечивающих повышение производительности труда, конкурентоспособности с/х производства и потребительского спроса на внутреннем и внешнем рынках, улучшение социального положения сельских жителей;

● социально-гуманитарные, историко-культурные и психологические исследования развития казахстанского общества в условиях глобализации.

В научных школах ученые успешно осуществляют  подготовку научных кадров по прикладным и фундаментальным наукам. Исследования проводятся по грантовым и инициативным темам. Руководителями научных исследований являются доктора наук университета: Колдыбаев С.А., Харченко С.В., Найманов Д.К., Пионтковский В.И., Ким Н.П., Айтмухамбетов А.А., Легкий Д.М., Тегза А.А., Кушнир В.Г., Курманов А.К., Кальнаус В.И., Жиентаев С.М., Мишулина О.В., Васильчук Е.В. и другие.