Сондай-ақ, лабораториямен қатар археологиялық мұражай өз қызметін атқарып жатыр. Мұражай экспонаттары Қостанай облысының төңірегінде табылған. Мұражай экспозициясында өлкенің әрбір археологиялық дәуірі көрсетілген, ежелгі тас дәуірінен бастап орта ғасырға дейін. 

Археологиялық мұражай экскурсиялары

Маханжар (неолит, б.ғ.д. 7 – 5 мың) және терсек (энеолит, б.ғ.д. 4 – 3 мың)  мәдениеттеріне үлкен ықылас бөлінген.

Қола дәуірі Андронов мәдени-тарихи ортақтығымен көрсетілген.

	Бестамақ (бестамак на казахском.doc), Халвай 3, Джагелді 5 обалар өлкенің индоарийларының негізгі ескерткіштері болып табылады. Мұражай экспозицияларының ерекшелігі андронов  әйелдің жерлеуге киетін, бұрын болған қалпына келтірілген костюмі және қоладан, тастан, сүйектен жасалған әшекейлер болып табылады.

Өлкенің ерте темір дәуірі сармат, сақ тайпаларымен байланысты; мәдениет артефактілеріне жеке орын арналған.

Торғай өлкесінің орта ғасыры жерлеу ескерткіштер мен ежелгі түрік тас мүсіндерімен көрсетілген. 

Археологиялық лабораторияның жұмысына гуманитарлық әлеуметтік факультеттің студенттері белсенді қатысады. Археологиялық лабораторияда 20 жылдай археологиялық үйірме, қызметі университеттен де тыс істейді, тек қана ҚМУ студенттері ғана емес, Қостанай қаласы, жалпы  облыстың көптеген оқу мекемелердің оқушылары үйірме жұмысына белсенді  қатысып тұрады. Археологиялық үйірменің жұмысы процесінде балалар шетел студенттерімен (Питсбург, Аризона, Челябинск, т.б.).  бір-бірімен танысып, тәжірибемен бөліседі.

2006 жылы археологиялық зерттеу лоборатория қызметкерлері, Сандра Олсен докторы (Carnegie Museum of Natural History) Бестамақ оба қазбаларында магнитометрия әдісін ең бірінші болып қолданды. 2011 жылы Торғай өлкесінде қола дәуіріне жататын металлдан жасалған заттарды Бохум қаласы Тау ісі Алмания мұражайдың Т. Штолльнер А.Гончаров, М. Шильхт мамандарымен зерттеу жұмыстарын  бірлесіп өткізді. Торғай жерінде әртүрлі археологиялық дәуірде өмір сүрген халықтың антропологиялық типі белсенді зерттеуде.
	Немістер  археологтарымен зерттеу жұмыстарын. 2011 жылы.